Plate-forme d’analyse et microséquençage des protéines
© Institut Pasteur
Responsable plate-forme : Jacques d’Alayer
Contact : jdalayer@pasteur.fr
Présentation :
L’activité principale de la plate-forme est la détermination de séquences d’acides aminés à partir de protéines et de peptides purifiés ou partiellement purifiés.
Elle poursuit parallèlement une activité de conseil et de mise au point des microtechniques nécessaires à la préparation des échantillons à analyser.
Elle peut aussi obtenir des séquences internes par coupures de protéines en fragments et purification des fragments par HPLC. Les séquences sont déterminées par séquençage automatique (séquenceurs Applied Biosystems 473 et 494) fonctionnant selon la méthode d’Edman ou par spectrométrie de masse à l’aide d’un appareil MALDI-TOF (C-terminal).
Une nouvelle technologie appelée "ProteinChip Technology®" (Ciphergen) est disponible à la plate-forme d’Analyse et de Microséquençage des Protéines. Elle combine la capture de protéines sur des surfaces chimiques et la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF.
C’est un outil pour la protéomique qui porte sur trois grandes applications :
- L’étude de l’expression différentielle de protéines pour, notamment, découvrir, valider et identifier de nouveaux bimarqueurs à partir d’extraits bruts (liquides biologiques, extraits cellulaires, tissulaires, etc.) ;
- L’étude d’interactions moléculaires spécifiques tels que récepteur/ligand, anticorps/antigène, protéine/protéine, ADN/protéine ;
- La purification, la caractérisation (analyse des modifications post-traductionnelles) et l’identification des protéines.
Source : site Internet Institut Pasteur
